Die Arbeit von pbi hat von vielen Seiten Anerkennung erfahren. Dies wird unter anderem anhand der ihr verliehenen Auszeichnungen deutlich:
Martin-Ennals-Preis
2001 erhielt pbi den renommierten und mit 20.000 Schweizer Franken dotierten Martin-Ennals-Preis. Mit dem nach dem ersten Generalsekretär von Amnesty International benannten Preis, wurde pbi für ihre Arbeit zum gewaltfreien Schutz von MenschenrechtsaktivistInnen (speziell in Kolumbien) ausgezeichnet.
Medalla Conmemorativa de la Paz
1999 überreichte Rigoberta Menchú Tum, Friedensnobelpreisträgerin von 1992, pbi diesen Preis für ihre Arbeit. Die Ehrung wird jährlich von der gleichnamigen Stiftung vorgenommen, die Frau Menchú Tum nach dem Nobelpreisgewinn gegründet hat. Rigoberta Menchú Tum ist bei ihrer Rückkehr aus dem Exil 1992 und viele Jahre danach von pbi begleitet worden.
Menschenrechtspreis der Stadt Weimar
Am 10. Dezember 1999, dem Internationalen Tag der Menschenrechte, erhielt die langjährige pbi-Freiwillige Heike Kammer den Menschenrechtspreis der Stadt Weimar für ihr außergewöhnliches Engagement zum Schutz der Menschenrechte in Lateinamerika.
Internationaler Aachener Friedenspreis
Im September 1999 wurde pbi mit dem Internationalen Aachener Friedenspreis ausgezeichnet. Sie wurde damit für die beeindruckende und wegweisende Menschenrechtsarbeit in Kolumbien geehrt. pbi selbst widmete die Auszeichnung den Menschen, die von Menschenrechtsverletzungen in Kolumbien betroffen sind.
Sievershausener Friedenspreis
1998 erhielt pbi den Sievershausener Friedenspreis als Anerkennung für ihre Leistungen auf dem Gebiet der gewaltfreien Konfliktbearbeitung. Die Auszeichnung wird vom Antikriegs-Zentrum Sievershausen verliehen.
Pfeffer Friedenspreis
1996 wurde pbi mit dem Pfeffer Friedenspreis ausgezeichnet. Dieser Preis wird vom Internationalen Versöhnungsbund an Individuen und Organisationen verliehen, die sich mit gewaltfreien Mitteln für eine Konflikttransformation einsetzen.
Friedrich Sigmund-Schultze Förderpreis
1995 wurde pbi für gewaltfreies Handeln und zivile Konfliktbearbeitung von der Arbeitsgemeinschaft zur Betreuung der Kriegsdienstverweigerer der Evangelischen Kirche in Deutschland der Friedrich Sigmund-Schultze Förderpreis verliehen.
Memorial por la Paz y la Solidaridad entre los Pueblos
Ebenfalls im Jahr 1995 erhielt pbi diesen Preis zur Würdigung ihrer Menschenrechtsarbeit. Anlass war die 10-Jahres-Feier der Verleihung des Friedensnobelpreises an Adolfo Perez Esquivel.
